banner

Блог

Jul 17, 2023

Комплексный анализ роли QPRT при раке молочной железы

Том 13 научных отчетов, номер статьи: 15414 (2023) Цитировать эту статью

428 Доступов

1 Альтметрика

Подробности о метриках

Изучить клиническую роль QPRT при раке молочной железы. Экспрессию генов, уровни метилирования и прогностическую ценность QPRT при раке молочной железы анализировали с использованием данных TCGA. Проверка проводилась с использованием данных из набора данных GEO и базы данных TNMPLOT. Метод метаанализа использовался для объединения данных о выживаемости для QPRT. Прогностические значения QPRT для различных препаратов были получены из графика ROC. Различия в экспрессии QPRT в приобретенных устойчивых к лекарствам и чувствительных клеточных линиях были проанализированы с использованием наборов данных GEO. Анализ обогащения GO и KEGG был проведен для тех генов, которые в высокой степени коэкспрессировались с QPRT в ткани на основании данных TCGA и которые изменились после нокдауна QPRT. Timer2.0 использовался для изучения корреляции между QPRT и инфильтрацией иммунных клеток, а Атлас белков человека использовался для анализа данных секвенирования отдельных клеток QPRT в различных тканях человека. Экспрессию QPRT в различных типах макрофагов и экспрессию QPRT анализировали после совместного культивирования HER2+ клеток рака молочной железы с макрофагами. Кроме того, TargetScan, Сравнительная токсикогеномика и карта связности использовались для исследования микроРНК и лекарств, которые могли бы регулировать экспрессию QPRT. Cytoscape использовался для картирования сетей взаимодействия между QPRT и другими белками. QPRT был высоко экспрессирован в ткани рака молочной железы и высоко экспрессирован у пациентов с раком молочной железы HER2+ (P <0,01). Высокие уровни экспрессии QPRT были связаны с худшими показателями OS, DMFS и RFS (P <0,01). Было обнаружено, что два сайта (cg02640602 и cg06453916) являются потенциальными регуляторами рака молочной железы (P <0,01). QPRT может предсказать улучшение выживаемости у пациентов с раком молочной железы, получавших таксан или антрациклин. QPRT был связан с опухолевым иммунитетом, особенно в макрофагах. QPRT может влиять на возникновение и прогрессирование рака молочной железы через сигнальный путь PI3K-AKT, сигнальный путь Wnt и молекулы, связанные с клеточным циклом.

Данные Международного агентства по исследованию рака (IARC) показывают, что рак молочной железы стал самым высоким уровнем заболеваемости злокачественными опухолями в мире и одной из ведущих причин смертности среди женщин1. Рак молочной железы подразделяется на различные биологические подтипы со сложной гетерогенностью. В клинической практике существует четыре распространенных молекулярных типа, включая люминал-А, люминал-В, положительный по рецептору человеческого эпидермального фактора роста 2 (HER2) и трижды отрицательный2, что приводит к различным методам лечения3. Хотя рак молочной железы является одной из солидных опухолей с лучшими эффектами лечения, гетерогенность различных молекулярных подтипов рака молочной железы приводит к разным методам лечения4, что затрудняет проведение персонализированной точной терапии у пациентов.

Несмотря на значительный прогресс в современных фронтальных и эффективных методах лечения, системная терапия до сих пор не может полностью вылечить метастатический рак молочной железы, улучшить качество жизни5, облегчить симптомы, вызванные метастазами, и продлить относительную долгосрочную выживаемость6. Учитывая значительный уровень смертности, важно изучить новые методы сдерживания развития системных злокачественных метастазов. Самой большой проблемой в лечении метастатического рака молочной железы является устойчивость к системной химиотерапии и таргетной терапии, которая до сих пор была непреодолимой. Лечение метастатического рака молочной железы должно проводиться индивидуально. Клинически комбинированная химиотерапия может улучшить частоту ответа на лечение и продлить выживаемость без прогрессирования у некоторых пациентов. Однако постепенное формирование лекарственной устойчивости приводит к потере значительной клинической пользы лекарственной терапии. Существует множество известных механизмов лекарственной устойчивости, включая ускорение оттока лекарств, активацию и инактивацию лекарств, изменения мишеней лекарств и эпигенетические модификации, вызванные или полученные в результате мутаций7. Было разработано несколько стратегий для предотвращения или преодоления резистентности к системной противораковой терапии, включая комбинации препаратов и последовательные схемы лечения. Однако кажется, что устойчивость пациентов к существующим лекарствам и схемам лечения неизбежна8. Поэтому мы надеемся на дальнейшее уточнение клеточных и молекулярных процессов лекарственной устойчивости опухолевых клеток, использование новых препаратов для борьбы с этими механизмами и постепенное улучшение прогноза пациентов с метастатическим раком молочной железы9.

 0.5)./p> 0.25, P < 0.05), and 317 genes were negatively correlated (r < − 0.25, P < 0.05)./p> 99) (Fig. 7A). To further explore possible drug targets of QPRT, the Comparative Toxicogenomics Database (CTD) was used. The results visualized by Cytoscape showed that a series of drugs can target QPRT, such as antineoplastic drugs such as cisplatin, Jinfukang, flutamide, and entinostat and substances in the human body such as oestradiol, lactic acid, and testosterone (Fig. 7B). The intersection of the above results and the results of the CMAP website analysis found that these drugs appeared repeatedly, including clofibrate, cytarabine, entinostat, estradiol, flutamide, niacin, resveratrol, rosiglitazone, testosterone, tretinoin and valdecoxib. This suggests that QPRT is more likely to be associated with these drugs and affect breast cancer directly or indirectly. In addition, based on the three databases of iRefIndex, BioGrid and IMEx, we draw the protein–protein interaction networks (PPI) related to QPRT respectively (Fig. 7C–E). We summarized the results of these three databases and found that these genes or proteins appeared in these three databases, including PKLR, AMBP, APOC3, RBP4, APOM, TF, UBE2J1, DNAJB9, SEC61B, HILPDA, LIPA, YIPF5, SEC23IP and SEC24C. We reasonably believe that QPRT is likely to interact with these genes or proteins and affect the progression of breast cancer. We speculated that these biomolecules and comparative toxicogenomics can prevent breast cancer deterioration and even improve patient survival status./p>

ДЕЛИТЬСЯ